48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2796 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  71.26 
 
 		 1172 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1126 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  47.13 
 
 		 1082 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1116 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1118 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  50 
 
 		 1153 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  50 
 
 		 1163 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  45.57 
 
 		 1215 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  50 
 
 		 1143 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  48.57 
 
 		 1151 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  58.82 
 
 		 1143 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  58.82 
 
 		 1143 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  42.86 
 
 		 1228 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  43.02 
 
 		 1280 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  40.8 
 
 		 1270 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  56.86 
 
 		 1139 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  47.06 
 
 		 1198 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  50.79 
 
 		 1250 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1247 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  53.57 
 
 		 1215 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1121 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  41.57 
 
 		 1196 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  46.75 
 
 		 1324 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  44.59 
 
 		 1350 aa  61.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1175 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  41.38 
 
 		 797 aa  48.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  40 
 
 		 1090 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  40 
 
 		 1077 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  42.11 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  36.56 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  45.76 
 
 		 521 aa  45.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.01 
 
 		 1620 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  38.03 
 
 		 1099 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  35 
 
 		 1190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  41.51 
 
 		 632 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  39.62 
 
 		 635 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  36.51 
 
 		 464 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  36.23 
 
 		 636 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.83 
 
 		 902 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  32.1 
 
 		 633 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  34.88 
 
 		 622 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  34.21 
 
 		 611 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  35 
 
 		 986 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  39.62 
 
 		 553 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  39.62 
 
 		 553 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  37.74 
 
 		 636 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  40.91 
 
 		 2245 aa  41.2  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>