56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1769 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.39 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.73 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.02 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.39 
 
 		 281 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.49 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.01 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.71 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  34.02 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.24 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.77 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  32.23 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.61 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  27 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  28.3 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  32.48 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  29.38 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.55 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.55 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  27.81 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.66 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  31.37 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  30 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  28.81 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.5 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  28.46 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  28.47 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  29.1 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  26.58 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  26.13 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  26.13 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.56 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.44 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  29.1 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.32 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  29.1 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  25.68 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.03 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.68 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  27.12 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  34.51 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  27.12 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  25.51 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.41 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  32.11 
 
 		 239 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.72 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.81 
 
 		 278 aa  41.6  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>