86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0678 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  247  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  91.96 
 
 		 115 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  91.96 
 
 		 115 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  80.91 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  69.72 
 
 		 120 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  67.89 
 
 		 120 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  64.91 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  56.19 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  49.53 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  65.38 
 
 		 80 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  39.42 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.64 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  34 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  32.29 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.57 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  27.96 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  30.3 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  31.11 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  26.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  26.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  25.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.12 
 
 		 280 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  29.55 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.83 
 
 		 289 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  30.77 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  29.87 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  30.86 
 
 		 329 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  26.67 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  29.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.62 
 
 		 280 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  28 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  31.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  27.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  24.69 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  27.88 
 
 		 269 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  24.73 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  29.76 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  27.66 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  25.97 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  33.33 
 
 		 547 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  28.26 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  28.26 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.14 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  29.35 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  28.26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  28.26 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  32.5 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  30.12 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  28.26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  28.21 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  25.84 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  27.71 
 
 		 282 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  28.21 
 
 		 303 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  26.51 
 
 		 302 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.29 
 
 		 286 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  31.87 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  26.92 
 
 		 287 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  33.77 
 
 		 119 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  30.49 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  30 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  29.11 
 
 		 555 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  26.37 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  28.38 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  31.75 
 
 		 460 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.67 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  30 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  23.53 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  28.38 
 
 		 129 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>