164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4134 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4037  periplasmic sugar-binding protein, putative  97.37 
 
 
342 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3939  periplasmic sugar-binding protein, putative  97.95 
 
 
342 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4015  periplasmic sugar-binding protein, putative  97.37 
 
 
342 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4134  periplasmic sugar-binding protein, putative  100 
 
 
342 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0349  periplasmic sugar-binding protein, putative  70.5 
 
 
348 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.748308  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0355  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.32 
 
 
341 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3671  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.03 
 
 
341 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.669909  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3287  periplasmic sugar-binding protein  50.65 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4172  periplasmic sugar-binding protein, putative  48.57 
 
 
348 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.27 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00186046  normal  0.396691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3323  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.93 
 
 
358 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4053  periplasmic sugar-binding protein, putative  31.87 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299221  normal  0.087362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2372  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.58 
 
 
358 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3110  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.19 
 
 
357 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2881  periplasmic sugar-binding protein, putative  29.7 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1885  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.32 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1979  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.53 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744859  normal  0.0549278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2731  periplasmic sugar-binding domain protein  27.49 
 
 
357 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2463  sugar-binding domain-containing protein  26.54 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155285  hitchhiker  0.00853045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3835  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.92 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0841  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.57 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03960  D-allose transporter subunit  22.83 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3903  Monosaccharide-transporting ATPase  22.83 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03920  hypothetical protein  22.83 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3938  D-allose transporter subunit  22.83 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4554  D-allose transporter subunit  22.83 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1581  ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.28 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0249545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  22.49 
 
 
904 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4908  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.82 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  28.26 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.91 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.26 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.25 
 
 
328 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7364  ABC transporter substrate binding protein  32.97 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180283  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1582  ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.09 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000317911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1110  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  31.82 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.963711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.97 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  34.15 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.69 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22080  periplasmic sugar-binding protein  27.01 
 
 
333 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5046  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  21.24 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  26.29 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.07 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1793  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  25.18 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0810  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1101  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0362  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.18 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2074  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0039  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.79 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4364  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.93 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0398536  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  22.02 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04096  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.63 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4856  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3327  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.7 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.888575  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.63 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  30.83 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4705  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0457  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3783  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.58 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  19.84 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2127  ABC transporter periplasmic-binding protein ytfQ precursor  22.3 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5265  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.09 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.108745  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2475  monosaccharide-transporting ATPase  26.19 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0147  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.62 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  22.02 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.63 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.330305 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4481  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4797  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4768  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.62 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379262  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0475  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  21.62 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0527662 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04060  hypothetical protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  22.02 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4068  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.62 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5745  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.63 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2238  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.45 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442154  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1720  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000157019  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0412  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  19.9 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1418  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.17 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159332  normal  0.228113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2473  periplasmic substrate-binding protein  24.55 
 
 
306 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.265832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  24.26 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0598  putative sucrose operon repressor ScrR  30.83 
 
 
330 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00468324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0970  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.53 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2160  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  26.86 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  46.81 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  29.81 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1986  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.84 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277686  normal  0.0546729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1988  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.84 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188386  hitchhiker  0.000242477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2073  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.84 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.269264  hitchhiker  0.00000246592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0247  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.78 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  32.99 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.735803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>