102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4274 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4274  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4180  hypothetical protein  99.67 
 
 		 300 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5253  hypothetical protein  97.67 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03690  conserved hypothetical protein  96 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03639  hypothetical protein  96 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0382  protein of unknown function DUF62  59.93 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0505  protein of unknown function DUF62  57.48 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4936  protein of unknown function DUF62  56.85 
 
 		 297 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6514  protein of unknown function DUF62  57.34 
 
 		 298 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0914028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2821  protein of unknown function DUF62  57.51 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372456  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1498  hypothetical protein  52.92 
 
 		 282 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07650  hypothetical protein  48.74 
 
 		 279 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0345  hypothetical protein  49.29 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00540766  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2710  hypothetical protein  48.38 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2767  hypothetical protein  48.38 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0260268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1975  hypothetical protein  46.29 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1546  hypothetical protein  35.69 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.890208  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0271  hypothetical protein  35.56 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1067  hypothetical protein  35.23 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0269  hypothetical protein  35.56 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.136318  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2013  hypothetical protein  34.67 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00694223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2209  hypothetical protein  32.72 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.171783  normal  0.703654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1350  protein of unknown function DUF62  41.1 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0963991  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0002  hypothetical protein  31.52 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.246824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2370  protein of unknown function DUF62  31.8 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0792  protein of unknown function DUF62  33.58 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0222  hypothetical protein  34.69 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0603  hypothetical protein  35.16 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1293  protein of unknown function DUF62  34.93 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1320  protein of unknown function DUF62  34.06 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0998105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1448  protein of unknown function DUF62  30.77 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1405  hypothetical protein  30.11 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.01301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0388  hypothetical protein  31.5 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0080  hypothetical protein  33.21 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.158966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3794  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3530  hypothetical protein  37.61 
 
 		 276 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1026  hypothetical protein  30.34 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0749634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4783  hypothetical protein  35.23 
 
 		 271 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0919  hypothetical protein  33.09 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628003  normal  0.0175561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2034  protein of unknown function DUF62  30.74 
 
 		 268 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1901  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2641  protein of unknown function DUF62  34.54 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0408  protein of unknown function DUF62  31.77 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1364  hypothetical protein  33.97 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0427667  hitchhiker  0.000196172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1391  protein of unknown function DUF62  29.96 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4209  hypothetical protein  32.57 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3306  hypothetical protein  32.58 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1832  protein of unknown function DUF62  30.94 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2703  hypothetical protein  31.16 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0608  hypothetical protein  34.9 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.425504  normal  0.0157157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1230  protein of unknown function DUF62  28.62 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3689  protein of unknown function DUF62  33.21 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1378  hypothetical protein  32.7 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.278488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2027  hypothetical protein  28.28 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.920292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0216  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0702  hypothetical protein  33.85 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00401534  normal  0.259483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1405  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1168  protein of unknown function DUF62  31.39 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1827 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8926  protein of unknown function DUF62  30.66 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0791  hypothetical protein  31.27 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1412  hypothetical protein  28.47 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3529  hypothetical protein  34.72 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.879853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3652  hypothetical protein  34.16 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000216585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0668  hypothetical protein  29.8 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1548  hypothetical protein  29.96 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1909  hypothetical protein  37.3 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1640  protein of unknown function DUF62  29.3 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0566  protein of unknown function DUF62  30.6 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0614  protein of unknown function DUF62  33.02 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0140429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2246  protein of unknown function DUF62  31.5 
 
 		 274 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1507  hypothetical protein  28.91 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.941751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0432  hypothetical protein  30.34 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0005  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2362  hypothetical protein  28.69 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2242  hypothetical protein  31.83 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  decreased coverage  0.00672311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1502  protein of unknown function DUF62  31.38 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1597  protein of unknown function DUF62  31.91 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2069  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1438  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0876  hypothetical protein  32.09 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000358269  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6138  hypothetical protein  28.2 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500966  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0204  hypothetical protein  25.28 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08376  hypothetical protein  29.95 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0139079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2108  protein of unknown function DUF62  26.64 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.111438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2297  hypothetical protein  29.02 
 
 		 242 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.515706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3201  protein of unknown function DUF62  29.67 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2970  hypothetical protein  27.76 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00085144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2899  protein of unknown function DUF62  27.64 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0750848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1673  protein of unknown function DUF62  25.3 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0478  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1485  hypothetical protein  40.18 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.275435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1862  protein of unknown function DUF62  25.4 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2724  hypothetical protein  27.04 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2825  protein of unknown function DUF62  26.62 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0831  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1036  protein of unknown function DUF62  27.78 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4666  protein of unknown function DUF62  25.58 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.123818  hitchhiker  0.000000000393742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2298  hypothetical protein  23.86 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.452594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0485  hypothetical protein  29.32 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>