261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1977 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1977  thymidylate synthase  100 
 
 		 316 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1332  thymidylate synthase  70.29 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0118279  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3787  thymidylate synthase  64.26 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0846  thymidylate synthase  59.48 
 
 		 298 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  58.5 
 
 		 298 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  58.82 
 
 		 298 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  48.5 
 
 		 264 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  48.5 
 
 		 264 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  48.84 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  48.84 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  48.84 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  49.17 
 
 		 274 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 264 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  48.84 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  47.84 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  47.84 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  45.18 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  46.84 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  47.67 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  46.18 
 
 		 264 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  47.33 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  45.85 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  47.67 
 
 		 267 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  47.33 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  47.67 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  46 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  46.1 
 
 		 277 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  46.1 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  46.84 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 279 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  45.18 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  45.85 
 
 		 264 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  44.85 
 
 		 264 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  45.33 
 
 		 264 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  47.39 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  46.84 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  43.85 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0544  thymidylate synthase  45.51 
 
 		 264 aa  260  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.249699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  45.85 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  45.21 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  47 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  43.63 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  44.81 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  45.51 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  45 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 283 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  41.23 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  46.58 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  46.18 
 
 		 276 aa  255  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  44.81 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  41.41 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  43.35 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  45.45 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  41.41 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  44.52 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  44.67 
 
 		 264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  44.67 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  46 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  41.16 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2772  thymidylate synthase  44.48 
 
 		 276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.023604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  45.33 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  45.33 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  40.85 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  43.83 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  44.86 
 
 		 282 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  44.52 
 
 		 264 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  41.91 
 
 		 288 aa  252  8.000000000000001e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  43.85 
 
 		 264 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>