More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1958 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  84.49 
 
 		 187 aa  334  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  79.68 
 
 		 187 aa  315  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  60.22 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  60.22 
 
 		 186 aa  249  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  59.68 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  61.5 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  57.38 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  61.08 
 
 		 189 aa  238  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  59.36 
 
 		 187 aa  237  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  58.6 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  57.3 
 
 		 187 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  54.79 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  55.68 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  55.14 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  53.76 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  51.34 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  54.6 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  53.45 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  53.45 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  53.76 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  41.4 
 
 		 188 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  41.94 
 
 		 216 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  44.09 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  43.32 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  43.01 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  42.47 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  42.46 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  42.78 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  44.81 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  40.86 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  40.86 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  41.4 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  45.25 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  41.4 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  39.25 
 
 		 207 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  39.25 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  39.25 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  38.8 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  37.02 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  37.02 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  39.44 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  38.8 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  39.01 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  37.02 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  38.25 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  38.42 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.8 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  39.67 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.44 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  36.93 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  35.87 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  37.3 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  37.7 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  34.81 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  35.91 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  36.67 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  37.7 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  34.64 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.91 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  36.76 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  35.56 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  34.81 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  33.15 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  36.22 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  35.87 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  35.16 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  36.46 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  33.15 
 
 		 211 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  36.61 
 
 		 185 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  35.68 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  35.56 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>