More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1563 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  64.76 
 
 		 531 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 531 aa  1070    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  46.57 
 
 		 536 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  44.42 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  37.41 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  37.41 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  36.8 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  36.8 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  35.24 
 
 		 549 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  36.7 
 
 		 548 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 550 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  34.59 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 		 549 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  38.38 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  37.07 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 544 aa  257  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.32 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  34.26 
 
 		 540 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 557 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  33.03 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  33.03 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.31 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  30.41 
 
 		 529 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.92 
 
 		 503 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 520 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  29.53 
 
 		 532 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  29.06 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28.9 
 
 		 556 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.48 
 
 		 570 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  31.96 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.45 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.81 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1244  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.248207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 512 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 511 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 549 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  28.02 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 515 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.72 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 502 aa  156  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 534 aa  156  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>