More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1142 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
269 aa  525  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.86 
 
 
268 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.76 
 
 
286 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 
276 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 
277 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
277 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
272 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.45 
 
 
276 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
269 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
271 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
278 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.53 
 
 
272 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
269 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.16 
 
 
272 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.93 
 
 
301 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
273 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.69 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
271 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
274 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
271 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
266 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
277 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
273 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 
272 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.69 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
273 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
289 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.74 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.38 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
274 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 
300 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.83 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.99 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.35 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.3 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
293 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.45 
 
 
255 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  30.88 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 
272 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
273 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.89 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  31.09 
 
 
283 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.99 
 
 
278 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.68 
 
 
264 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.89 
 
 
273 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  30.39 
 
 
262 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
273 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
279 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.82 
 
 
278 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.31 
 
 
267 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
282 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 
275 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.63 
 
 
274 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 
275 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
268 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.74 
 
 
285 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
277 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.53 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.67 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.11 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.22 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.44 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
282 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
280 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
274 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
263 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>