184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1095 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1095  twin-arginine translocation protein TatB  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.25 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  47.2 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.05 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  45.07 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  46.48 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  48.53 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  45.07 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  41.84 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  45.59 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.48 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.22 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  44.12 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.34 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.56 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  44.62 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  46.15 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  42.65 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.31 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  46.15 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.1 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  41.79 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.08 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.85 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.69 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.54 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.12 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  40.32 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.66 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.94 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.7 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.36 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  40.51 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.26 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  34.02 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  31 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  30.4 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  30.4 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  30.4 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  30.4 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  30.4 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  35.71 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.92 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  33.78 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.94 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.96 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.29 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  49.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  50.79 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.19 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.58 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  31.68 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  50.79 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  33.82 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  28.7 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.85 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.98 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.77 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.76 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  50.79 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  48.44 
 
 		 316 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.38 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.65 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  50 
 
 		 203 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  50 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  30.88 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  27.59 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  31.43 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  37.25 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5156  sec-independent protein translocase TatB  36.59 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.15 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.5 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  32.79 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  34.67 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.14 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>