More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1021 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
400 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  54 
 
 
401 aa  368  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  56.89 
 
 
398 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  42.96 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.8 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  42.93 
 
 
405 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  41.96 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  42.57 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.73 
 
 
422 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  44.56 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  42.21 
 
 
417 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  42.78 
 
 
420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  38.5 
 
 
417 aa  259  7e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  45.67 
 
 
389 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  43.61 
 
 
417 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  43.8 
 
 
417 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  43.28 
 
 
418 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  42.89 
 
 
417 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.45 
 
 
418 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  43.19 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  42.54 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  43.8 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  42.75 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  37.85 
 
 
391 aa  233  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  51.34 
 
 
379 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  42.82 
 
 
406 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  39.74 
 
 
419 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.94 
 
 
421 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.56 
 
 
420 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  35.36 
 
 
392 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  32.63 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  33.51 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  40.1 
 
 
417 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.58 
 
 
419 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  43.13 
 
 
424 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  41.08 
 
 
525 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.72 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  44.6 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  44.13 
 
 
382 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  41.34 
 
 
418 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.37 
 
 
417 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  42.6 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  42.23 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  50.81 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  50 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.35 
 
 
427 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.77 
 
 
399 aa  137  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  44.32 
 
 
451 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  42.47 
 
 
434 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  40 
 
 
471 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
454 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  30.03 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  34.46 
 
 
410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  35.24 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.3 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.75 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.75 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.08 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.84 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
448 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
465 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.71 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  38.54 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.55 
 
 
484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  31.2 
 
 
484 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  36.82 
 
 
510 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  33.66 
 
 
424 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.62 
 
 
398 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.18 
 
 
448 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  38.02 
 
 
466 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  36.46 
 
 
456 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 
491 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
552 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.95 
 
 
473 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  33.17 
 
 
422 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  39 
 
 
436 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.02 
 
 
397 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.15 
 
 
402 aa  106  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3131  poly(A) polymerase  33.8 
 
 
480 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000115831  normal  0.0863023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  36.97 
 
 
485 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.98 
 
 
404 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.17 
 
 
403 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  33 
 
 
427 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  33.96 
 
 
496 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  38.62 
 
 
447 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  36.8 
 
 
436 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
583 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  34.53 
 
 
455 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  31.72 
 
 
466 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  32.87 
 
 
421 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2862  poly(A) polymerase  31.47 
 
 
521 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 
485 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>