More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2887 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
371 aa  741    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  67.22 
 
 
368 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  63.03 
 
 
372 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
378 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
392 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  50.71 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  49.47 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  47.47 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  48.34 
 
 
365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  45.68 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  47.67 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 
365 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  46.85 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  48.94 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  49.2 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  47.72 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  48.34 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  47.12 
 
 
365 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  47.12 
 
 
361 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
369 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  47.12 
 
 
361 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  45.98 
 
 
362 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  45.6 
 
 
368 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  46.15 
 
 
365 aa  292  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  46.85 
 
 
361 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  46.52 
 
 
368 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  46.05 
 
 
368 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  45 
 
 
369 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  44.85 
 
 
373 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  45.83 
 
 
364 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  47.62 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  48.63 
 
 
370 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
370 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  47.86 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  39.84 
 
 
392 aa  258  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  42.42 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  39.62 
 
 
373 aa  249  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  42.33 
 
 
369 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  41.32 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  41.81 
 
 
374 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  40.44 
 
 
374 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 
363 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
369 aa  239  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  40.6 
 
 
369 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 
365 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  39.34 
 
 
371 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 
373 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  40.83 
 
 
368 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
370 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 
369 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
374 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
370 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.82 
 
 
376 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.81 
 
 
358 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
370 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.3 
 
 
362 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
383 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.51 
 
 
369 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  38.96 
 
 
370 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.22 
 
 
367 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  39.1 
 
 
386 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 
370 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  39.19 
 
 
385 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
364 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  39.36 
 
 
394 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 
380 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
374 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
368 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  38.3 
 
 
384 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
362 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
371 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
362 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
374 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.79 
 
 
374 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 
362 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  40.69 
 
 
381 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  37.7 
 
 
370 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.04 
 
 
373 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  41.01 
 
 
365 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
365 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
365 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 
379 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.13 
 
 
372 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
369 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 
366 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
367 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
369 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
388 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
370 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>