45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1089 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1089  TM2  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  56.94 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  51.19 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1932  TM2 domain containing protein  43.43 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.533409  normal  0.0149218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1604  TM2 domain containing protein  43.43 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.345673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1614  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  45.71 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  50.88 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  41.77 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  44.93 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  46.43 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  43.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  41.25 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  43.75 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  46.51 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  42.19 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  39.68 
 
 		 336 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  46.03 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  38.96 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  33.98 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1715  TM2  37.35 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.67624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  30.7 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  39.51 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2084  TM2 domain containing protein  38.57 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  36.59 
 
 		 139 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 176 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0744  TM2  42.25 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 139 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  34.62 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  40 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1809  TM2  36.9 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  43.48 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  37.84 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 131 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 139 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 116 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>