More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0561 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  70.43 
 
 		 232 aa  332  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  69.57 
 
 		 243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  67.1 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  66.52 
 
 		 232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  67.39 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  64.94 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  65.65 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  65.37 
 
 		 232 aa  316  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  64.94 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  63.64 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  63.64 
 
 		 232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  63.48 
 
 		 232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  63.48 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  63.04 
 
 		 232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  63.2 
 
 		 232 aa  307  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  63.04 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  64.94 
 
 		 233 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  63.2 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  61.9 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  63.48 
 
 		 231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  61.04 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  62.5 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  59.74 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  57.08 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  49.78 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  50.43 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  46.32 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  49.35 
 
 		 232 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  48.92 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  48.05 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  48.92 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  45.89 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  48.48 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  50.24 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  47.66 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  46.35 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  45.89 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  47.66 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  45.45 
 
 		 356 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  41.15 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  46.35 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  44.59 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  46.12 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  45.45 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  43.67 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  38.82 
 
 		 253 aa  194  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  45.02 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  41.18 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  47.32 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  45.02 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  47.32 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  46.83 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  41.18 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  43.72 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  44.16 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  44.16 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  44.16 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  43.72 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  43.72 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  44.16 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  40.52 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  40.52 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  45.85 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  42.86 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  45.85 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  45.89 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  45.06 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  43.72 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  45.85 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  41.99 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  41.99 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  41.99 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  43.78 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  40.43 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  43.72 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  41.94 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  43.29 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  42.86 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  42.86 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  41.56 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  43.72 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  42.42 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>