More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1334 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0699  valyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 987 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 947 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 947 aa  774    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1989  valyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 987 aa  751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2790  valyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 994 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 947 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 1029 aa  703    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 968 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 1031 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3087  valyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 987 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.705018  normal  0.448197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1214  valyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 990 aa  1009    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 977 aa  2004    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2331  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 1030 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748917  normal  0.908682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 930 aa  799    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 865 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2069  valyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 998 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 865 aa  558  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 882 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 880 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 866 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 874 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 885 aa  535  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 882 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 879 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 880 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 887 aa  529  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 874 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 880 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 883 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 887 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 881 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 883 aa  522  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 885 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 881 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 881 aa  522  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 895 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 886 aa  522  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 884 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 881 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 888 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 867 aa  518  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 880 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2150  valyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 907 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 880 aa  516  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 888 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 880 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 879 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 880 aa  511  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 917 aa  512  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 880 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 917 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 897 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 881 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 883 aa  509  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 929 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 886 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 881 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 881 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 921 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 881 aa  502  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 883 aa  502  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 892 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 881 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 884 aa  502  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 1002 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 909 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 909 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 922 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2144  valyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 920 aa  492  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 1006 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 929 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 879 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 893 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 922 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 972 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 952 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 957 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 911 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 943 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1474  valyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 1051 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 886 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 929 aa  486  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 891 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 1242 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 909 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 909 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0484  valyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 925 aa  486  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.762053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 924 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 892 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 904 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 926 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11620  valyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 944 aa  482  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 952 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>