121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3857 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  100 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  96 
 
 		 175 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  95.43 
 
 		 175 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  96.34 
 
 		 175 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  84.57 
 
 		 174 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  84 
 
 		 174 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  83.43 
 
 		 174 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  83.43 
 
 		 174 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  70.62 
 
 		 174 aa  258  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  66.29 
 
 		 175 aa  243  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  64 
 
 		 174 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  57.05 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.84 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  43.57 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.57 
 
 		 189 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.29 
 
 		 437 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.03 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.03 
 
 		 442 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.05 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  34.29 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.42 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.65 
 
 		 460 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.33 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  52.27 
 
 		 108 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  41.86 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.92 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.76 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.2 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.01 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  34.25 
 
 		 445 aa  71.2  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.35 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.75 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.1 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.98 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.21 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.21 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.62 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.74 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.8 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.87 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  37.5 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.39 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.59 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.07 
 
 		 278 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.78 
 
 		 265 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.15 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.1 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.65 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  29.79 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.66 
 
 		 199 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.87 
 
 		 317 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  35.56 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07660  phospholipid metabolism-related protein, putative  31 
 
 		 354 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.18 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  28.16 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02240  phospholipid metabolism-related protein, putative  33.98 
 
 		 396 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0798005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  32.5 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.09 
 
 		 1261 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.25 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.03 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.78 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  26.22 
 
 		 245 aa  45.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 271 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.19 
 
 		 272 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  32.32 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.03 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  26 
 
 		 222 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.83 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.07 
 
 		 279 aa  44.3  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  28.16 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.03 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  28.3 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.97 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  30.25 
 
 		 347 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.34 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0145  membrane-associated phospholipid phosphatase  26.77 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.85 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  42.37 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.39 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.54 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.11 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  32.88 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.74 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.74 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  30.3 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.87 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.19 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>