260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3261 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  99.03 
 
 		 829 aa  1669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  42.61 
 
 		 822 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  42.61 
 
 		 812 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.61 
 
 		 821 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  98.55 
 
 		 829 aa  1664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  99.16 
 
 		 829 aa  1674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  99.76 
 
 		 829 aa  1679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  41.79 
 
 		 834 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.02 
 
 		 832 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  100 
 
 		 829 aa  1683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.64 
 
 		 832 aa  772    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 830 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  41.5 
 
 		 833 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.47 
 
 		 828 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  39.3 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  39.38 
 
 		 826 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  39.02 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.05 
 
 		 846 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.02 
 
 		 826 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  39.9 
 
 		 816 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  40.02 
 
 		 833 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.02 
 
 		 819 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  40.02 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  40.02 
 
 		 833 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.02 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.57 
 
 		 844 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.4 
 
 		 835 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  40.24 
 
 		 881 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  40.85 
 
 		 881 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  40.24 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.8 
 
 		 845 aa  568  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  40.61 
 
 		 881 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  40.15 
 
 		 792 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  37.37 
 
 		 885 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  37.14 
 
 		 885 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  37.25 
 
 		 885 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  37.14 
 
 		 885 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  37.34 
 
 		 882 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  37.92 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  37.75 
 
 		 881 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.31 
 
 		 881 aa  522  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  37.56 
 
 		 880 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  37.51 
 
 		 881 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  37.44 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.53 
 
 		 829 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.11 
 
 		 828 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.11 
 
 		 828 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.99 
 
 		 828 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.77 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.67 
 
 		 817 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.99 
 
 		 828 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  36.84 
 
 		 813 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  36.72 
 
 		 813 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.72 
 
 		 813 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  36.72 
 
 		 813 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  38.74 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  30.81 
 
 		 820 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  30.26 
 
 		 861 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  30.26 
 
 		 866 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.86 
 
 		 865 aa  324  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  30.17 
 
 		 866 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.25 
 
 		 866 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  28.34 
 
 		 866 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.08 
 
 		 876 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  30.07 
 
 		 888 aa  304  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  29.32 
 
 		 839 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.67 
 
 		 837 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  29.53 
 
 		 871 aa  302  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.96 
 
 		 844 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.7 
 
 		 840 aa  300  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  31.24 
 
 		 838 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  31.24 
 
 		 863 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.07 
 
 		 866 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.12 
 
 		 838 aa  298  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  31.24 
 
 		 838 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  30.04 
 
 		 866 aa  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  29.95 
 
 		 866 aa  297  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  31.24 
 
 		 838 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  30.82 
 
 		 838 aa  297  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  29.95 
 
 		 866 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  29.95 
 
 		 866 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.95 
 
 		 866 aa  296  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.24 
 
 		 838 aa  296  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  28.84 
 
 		 840 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.06 
 
 		 866 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.25 
 
 		 833 aa  294  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  30.29 
 
 		 851 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.72 
 
 		 877 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  30.65 
 
 		 850 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.46 
 
 		 930 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.53 
 
 		 833 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  31.3 
 
 		 888 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  31.3 
 
 		 873 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  31.3 
 
 		 888 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  29.29 
 
 		 939 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.93 
 
 		 880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.53 
 
 		 833 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  28.99 
 
 		 914 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  31.3 
 
 		 888 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.79 
 
 		 863 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>