More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2426 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  47.78 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  28.71 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0169  transcription regulator ArsR family protein  45.83 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.537657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0293  transcription regulator ArsR family protein  45.83 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 347 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.3 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  36.71 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  44.59 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  36 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>