More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2003 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  84.36 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  84.36 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.92 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  58.02 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  57.79 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.88 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.04 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.43 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.54 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  54.73 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  55.14 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.44 
 
 		 275 aa  268  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  53.72 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  52.07 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  55.88 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  52.23 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  53.91 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  54.07 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  53.75 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.36 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.37 
 
 		 247 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 251 aa  264  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.96 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  52.85 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  52.07 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.04 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.85 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  52.02 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  52.44 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.2 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  54.58 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  54.58 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  54.58 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  55.97 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.2 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.21 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  50.61 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  51.9 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  53.25 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  50.61 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  53.97 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.27 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.33 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  50.61 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.32 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  51.67 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  51.22 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.7 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0210  polar amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  52.97 
 
 		 245 aa  258  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>