More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0873 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  100 
 
 		 416 aa  858    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  77.91 
 
 		 412 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  77.67 
 
 		 412 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  49.12 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  47.37 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.15 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  49.72 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  49.86 
 
 		 425 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  49.58 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  49.72 
 
 		 425 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  46.06 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  49.45 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  49.25 
 
 		 415 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  49.45 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  49.45 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  51.01 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  46.87 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  47.09 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0228  GTPase  45.14 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.67 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.65 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  43.87 
 
 		 421 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.14 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 		 509 aa  282  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.79 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.82 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.82 
 
 		 419 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.52 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.29 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.82 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.52 
 
 		 419 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.52 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.23 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.23 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  43.67 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.47 
 
 		 431 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.23 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.23 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.31 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  41.92 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.44 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  43.8 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  42.46 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  43.33 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  46.23 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  37.71 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  46.23 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  43.33 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  44.35 
 
 		 546 aa  265  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  42.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.74 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  44.97 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.76 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.03 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  46.06 
 
 		 582 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  41.48 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  44.92 
 
 		 485 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  37.8 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  44.83 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  43.52 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  46.18 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  42.55 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.2 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  41.54 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.48 
 
 		 493 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  42.68 
 
 		 515 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  42.19 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  44.83 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  41.71 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  44.51 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  43.25 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  44.2 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.1 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  43.89 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  43.23 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  39.12 
 
 		 517 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 487 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  43.17 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  37.53 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  39.82 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  44.2 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.63 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.63 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.49 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  39.82 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  39.82 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  43.89 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  40.76 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>