More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0490 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0490  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 231 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.507412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.18 
 
 		 231 aa  334  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00842826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.18 
 
 		 231 aa  334  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000039198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.43 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.96 
 
 		 222 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.57 
 
 		 222 aa  257  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.65 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5128  ABC transporter, permease protein  64.52 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0112  ABC transporter, permease protein  64.52 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0198801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.13 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0124248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5124  ABC transporter, permease protein  64.06 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0134076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5126  ABC transporter, permease protein  64.06 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0592267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4854  ABC transporter permease  62.33 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4695  ABC transporter, permease  62.33 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00753221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4710  ABC transporter, permease  62.33 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.9 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5221  ABC transporter permease  63.59 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.793852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5091  ABC transporter, permease protein  63.59 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.52 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.63 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  47.89 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.16 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  45.54 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.32 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.86 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 217 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.31 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  46.31 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.78 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  48.43 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  48.43 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03420  ABC-type metal ion transport system, permease component  46.15 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.09 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  39.81 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.29 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  42.72 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.41 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  50.81 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.36 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.85 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  42.36 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  43 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0192  DL-methionine transporter permease subunit  45.79 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000747175  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  44.29 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.91 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.73 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  44.44 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  42.38 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  44.39 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  42.06 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  42.06 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  46.8 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  42.06 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  40.87 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  47.57 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  43.96 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.57 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  40.55 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>