More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0157 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 454 aa  932    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  60.96 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  37.58 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 473 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 466 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.03 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 471 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 466 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.01 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 466 aa  289  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  35.45 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 473 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.85 
 
 		 488 aa  249  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 496 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.24 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.74 
 
 		 486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.75 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 476 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.67 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.68 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.34 
 
 		 481 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.54 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  26.86 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.35 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  30.53 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.05 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 492 aa  226  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  27.02 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.52 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 477 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.26 
 
 		 471 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 499 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 509 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.44 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 509 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 475 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 509 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 505 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 473 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.66 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.75 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.07 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.58 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.58 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>