55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0921 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0921  Tn916, transcriptional regulator, putative  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  32 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.66 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  30.65 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1619  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126669  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  30.65 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  30.65 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  32.26 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  30.65 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  30.65 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  29.76 
 
 
489 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
93 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  30.65 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  30.65 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0640  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  33.78 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
279 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
433 aa  40.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
72 aa  40.8  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 
432 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  33.9 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  25.49 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 
490 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 
504 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.67 
 
 
315 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
345 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
66 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>