More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2879 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  207  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  54.93 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  39.78 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  44 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.79 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  45.07 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  50 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  50 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  50 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  40.58 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  49.23 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
105 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  40 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 
95 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  40.4 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.21 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 
183 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>