More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1727 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  100 
 
 
331 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  46.67 
 
 
334 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  47.93 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  42.47 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  49.85 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  44.88 
 
 
330 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  51.37 
 
 
325 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  45.31 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.29 
 
 
339 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
333 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  43.75 
 
 
338 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  43.81 
 
 
338 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  40.61 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  40.9 
 
 
342 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 
344 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  41.27 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.28 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  36.64 
 
 
336 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 
341 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  35.43 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  35.24 
 
 
334 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  36.34 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  36.31 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  36.86 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
328 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.7 
 
 
341 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
328 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  32.08 
 
 
341 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.98 
 
 
338 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  33.33 
 
 
347 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 
330 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  33.76 
 
 
328 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  32.39 
 
 
341 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  33.44 
 
 
328 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  32.39 
 
 
341 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 
330 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.39 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36.42 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.87 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  31.64 
 
 
342 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
328 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.91 
 
 
337 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 
335 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
332 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 
336 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.22 
 
 
330 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.17 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 
328 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.41 
 
 
336 aa  165  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  36.27 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 
329 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  36.99 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.99 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  36.99 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  35.17 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  36.99 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 
337 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 
334 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  36.3 
 
 
328 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  35.39 
 
 
389 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  34.92 
 
 
317 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.64 
 
 
353 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  32.92 
 
 
316 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 
337 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.64 
 
 
330 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
331 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  32.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  33.71 
 
 
287 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  34.12 
 
 
338 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37 
 
 
352 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.52 
 
 
329 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  36.23 
 
 
338 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.82 
 
 
342 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.96 
 
 
349 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.95 
 
 
340 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  37.54 
 
 
341 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  35.98 
 
 
334 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
340 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  32.54 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  35.07 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.13 
 
 
335 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
342 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.85 
 
 
339 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  33.11 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  33.11 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  33.11 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  33.11 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  33.11 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 
340 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 
366 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.36 
 
 
345 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>