More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3545 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 345 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  44.93 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  47.25 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  45.06 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.35 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  41.81 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.61 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.22 
 
 		 343 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.79 
 
 		 348 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  43.9 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.99 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.73 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  40.35 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.64 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 347 aa  242  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  42.03 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.28 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.28 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.28 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.99 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.71 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.71 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.6 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  42.69 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  34.8 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  34.5 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.5 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  34.5 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  34.5 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  34.5 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.45 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.17 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  34.5 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.08 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.08 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.23 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.05 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  32.93 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  40.66 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.24 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.39 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.44 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.29 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.6 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  34.9 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.88 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  33.43 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.85 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.15 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.67 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.09 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  34.47 
 
 		 335 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  34.07 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.66 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  32 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.15 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  33.7 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.8 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 362 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.81 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.3 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>