79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3140 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  100 
 
 
357 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  97.48 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  37.98 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  28.24 
 
 
364 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07270  hypothetical protein  22.67 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.417127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  26.11 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  27.65 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
393 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  35.61 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  21.83 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.11 
 
 
420 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  27.49 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  31.25 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
930 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
374 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
364 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  18.97 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
378 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  20.22 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.92 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.39 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
394 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2185  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
437 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
424 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
437 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  22.22 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  28.79 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.78 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  30.54 
 
 
374 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
458 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
800 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  19.18 
 
 
350 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1369  hypothetical protein  22.55 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
380 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
430 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
359 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.84 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>