More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1906 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  100 
 
 		 333 aa  673    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 333 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  92.79 
 
 		 333 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.58 
 
 		 332 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.48 
 
 		 335 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.18 
 
 		 332 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.01 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80.06 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  76.81 
 
 		 332 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.2 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.3 
 
 		 322 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.26 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.56 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.06 
 
 		 334 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.74 
 
 		 334 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.43 
 
 		 334 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  75.33 
 
 		 308 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.55 
 
 		 334 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.34 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.99 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.48 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  51.75 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.19 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.16 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.41 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.26 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.43 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.43 
 
 		 365 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.41 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  38.18 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  39.93 
 
 		 275 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  36.9 
 
 		 276 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  38.01 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  37.45 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  38.4 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  37.36 
 
 		 275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  36.82 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.03 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  36.96 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  38.06 
 
 		 292 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  36.16 
 
 		 292 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  35.03 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  35.79 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  39.47 
 
 		 272 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  35.42 
 
 		 275 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  39.85 
 
 		 731 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  37.98 
 
 		 274 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  40.53 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  37.13 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.85 
 
 		 296 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  41.98 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  34.6 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  44.92 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  39.63 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  35.58 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  35.77 
 
 		 288 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  35.35 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.26 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.06 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  35.88 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  36.76 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  35.25 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  36.5 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  41.45 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  35.25 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  36.58 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  38.96 
 
 		 299 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  37.22 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  34.93 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  36.19 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  37.5 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  36.67 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  34.78 
 
 		 296 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  34.24 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  35.59 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.35 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  35.59 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.11 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  34.81 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  35.06 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  34.6 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  38.71 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  35.22 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  35.59 
 
 		 275 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  34.77 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.56 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  35.22 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  35.42 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  36.98 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.3 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  35.79 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  34.05 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  33.9 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  38.05 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  35.53 
 
 		 326 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  33.45 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  35.64 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>