58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1348 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  97.84 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  84.86 
 
 		 185 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  45.95 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0516  sarcosine oxidase, gamma subunit  47.37 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  47.5 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  32.26 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.87 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.45 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  32.26 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  30.63 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  33.54 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  30.65 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.65 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.53 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.74 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  27.54 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  33.93 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  33.93 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  27.54 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.54 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  27.78 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  27.54 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  27.98 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.57 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.95 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.95 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.12 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.65 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  25.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  25.9 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.63 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  26.32 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.12 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.6 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  29.29 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  29.41 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  31.21 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  23.6 
 
 		 364 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.43 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.71 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.71 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  23.17 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  30 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.85 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  29.75 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  26.01 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  35.65 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  31.36 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  28.03 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.16 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>