84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4297 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  71.09 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  57.26 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  45.53 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  44.63 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  44 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  48.74 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  45 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  45.38 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  47.15 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  44.63 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  44.63 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  45.45 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  44.63 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  41.6 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  41.94 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  40.98 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  45.61 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  45 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  40.94 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  43.41 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  41.27 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  41.8 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  43.65 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  46.22 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  38.79 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  45 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  41.59 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  45.76 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  36.84 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  31.54 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  36.84 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  36.84 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  33.87 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  34.65 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  34.65 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  40.15 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  36.43 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  43.14 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  38.1 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  43.96 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  35.2 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  38.14 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30.4 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  43.14 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  30.65 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  29.23 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  33.06 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  41.18 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  56.52 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  56.52 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  36.36 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  38.03 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  33.02 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  50 
 
 		 328 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  38.67 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  37.97 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  33.65 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  28.8 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  29.31 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  28.81 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  27.2 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  27.27 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  37.18 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  31.31 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  45.65 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  35.06 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  29.21 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  30.36 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  30.36 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  35.06 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.82 
 
 		 186 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  34.41 
 
 		 128 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  27.94 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  31.31 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  40.82 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  29.89 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  28.85 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>