More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3668 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
378 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  79.31 
 
 
261 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  82.45 
 
 
189 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  41.44 
 
 
394 aa  216  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  48.39 
 
 
244 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  53.54 
 
 
232 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  55.88 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  39.82 
 
 
234 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.72 
 
 
336 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36.32 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  37.14 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.69 
 
 
314 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  36.41 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  36.32 
 
 
354 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  36.32 
 
 
434 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
381 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  35.83 
 
 
372 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  35.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  34.13 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
372 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
334 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.63 
 
 
342 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 
338 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  34.39 
 
 
352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  37.56 
 
 
315 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  34.39 
 
 
352 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.64 
 
 
353 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 
425 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  34.2 
 
 
326 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  31.55 
 
 
370 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  37.63 
 
 
370 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  31.19 
 
 
301 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  33.19 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.48 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  27.65 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  32.19 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  27.65 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  27.19 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.14 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  33.49 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0618  quinol oxidase AA3, subunit II  25.81 
 
 
291 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  33.18 
 
 
300 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  25.21 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.27 
 
 
279 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1120  quinol oxidase AA3, subunit II  24.31 
 
 
366 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00144852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1143  quinol oxidase AA3, subunit II  24.31 
 
 
366 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.058304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 
311 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.35 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  30.67 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.4 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.73 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0646  quinol oxidase, subunit II  24.2 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  28.5 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.99 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.29 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  24.8 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  31.79 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  25.51 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.44 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  25.83 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  31.48 
 
 
299 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4778  ubiquinol oxidase, subunit II  32.89 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  26.71 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  37.9 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>