More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2036 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 333 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  92.79 
 
 		 333 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  92.79 
 
 		 333 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.18 
 
 		 335 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  81.68 
 
 		 332 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.58 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.81 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.81 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.44 
 
 		 331 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  76.44 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.67 
 
 		 322 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.26 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.12 
 
 		 334 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.3 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.74 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.43 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.25 
 
 		 334 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.93 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.72 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.9 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.99 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.52 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.62 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.41 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.04 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.84 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.21 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.25 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.11 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  38.52 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  37.78 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  38.38 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  39.55 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  36.9 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  37.08 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  38.78 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  37.22 
 
 		 273 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  36.82 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.36 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  36.47 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  40.61 
 
 		 731 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  37.36 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  36.9 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  42.34 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  38.87 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  38.35 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  35.71 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  37.6 
 
 		 274 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.52 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  40.45 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  37.6 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  35.37 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  38.74 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  38.04 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  35.77 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  37.41 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  40.54 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.74 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  36.64 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  37.04 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  41.03 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  37.32 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  35.53 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  35.69 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.35 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  37.32 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  36.64 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  37.23 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  36.57 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  34.89 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  35.42 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  35.69 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  37.45 
 
 		 275 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.3 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  36.67 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.06 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  36.96 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  36.9 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.76 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  35.94 
 
 		 288 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  37.05 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  36.9 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  36.96 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  45.45 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  35.79 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  35.93 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  37.04 
 
 		 296 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  36.36 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  37.32 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  37.32 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  37.14 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  36.9 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  36.58 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  38.55 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  35.84 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  37.96 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.98 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  35.96 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  36.33 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  35.87 
 
 		 326 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>