More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1400 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  100 
 
 		 397 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  52.49 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  44.15 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  41.2 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.8 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  31.47 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.86 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  26.05 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.8 
 
 		 188 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.6 
 
 		 182 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.6 
 
 		 182 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  35.59 
 
 		 191 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.92 
 
 		 204 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  37.36 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.51 
 
 		 181 aa  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.63 
 
 		 181 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  31.94 
 
 		 197 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.11 
 
 		 187 aa  86.3  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  34.9 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.84 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.95 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  35.11 
 
 		 188 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  34.95 
 
 		 184 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.96 
 
 		 178 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.61 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.8 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.27 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.05 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.84 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  28.65 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  36.69 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.69 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  28.11 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.76 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35.06 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.97 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.28 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.16 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.76 
 
 		 183 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.15 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.4 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  28.11 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  33.69 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.16 
 
 		 183 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.95 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.34 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.76 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.72 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  30.69 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.74 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  34.04 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  32.29 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  34.97 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  31.41 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  34.03 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.06 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  31.77 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  31.77 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.25 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.14 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  33.68 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.81 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  31.72 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.16 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.79 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  31.58 
 
 		 185 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.56 
 
 		 184 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.9 
 
 		 183 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  25.95 
 
 		 183 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  33.14 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  30.16 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  35.19 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  25.95 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.08 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  29.63 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.97 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30.05 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  28.49 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  32.43 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  25.95 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  25.95 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.89 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  26.94 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  30.16 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  32.62 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>