More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0865 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 225 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  84.89 
 
 		 225 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  84.44 
 
 		 225 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  59.01 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  56 
 
 		 226 aa  258  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  53.71 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  48.21 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  50.47 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  40.17 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  41.28 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  38.3 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.19 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  38.03 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  38.36 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  31.76 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.06 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  31.9 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  31.47 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  31.47 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  33.03 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  30.13 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  33.33 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  33 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  30.67 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  33.66 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  33.17 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.81 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  32.82 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  29.84 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  32.93 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.91 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  28.33 
 
 		 357 aa  75.1  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.18 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  24.24 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.8 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  26.98 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  27.59 
 
 		 258 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  27.57 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  27.66 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  26.42 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  26.67 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  31.14 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  25.91 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.05 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  28.86 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.94 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.59 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  26.46 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  28.88 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  29.65 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  29.53 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  24.36 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  29.53 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  26.56 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  30.41 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  27 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  23.37 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  29.15 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.16 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  25.65 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  29.53 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.21 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  27.23 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  26.63 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  28.16 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  30.41 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  33.59 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  28.64 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  31.11 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  30.82 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  27.81 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  26.7 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  31.47 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>