More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3108 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 328 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.3 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.05 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.39 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.3 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.38 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.03 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.56 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  42.76 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.31 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.91 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.07 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  41.78 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  36.88 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  36.07 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  40.07 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.01 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  32.06 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5210  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  32.75 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.69 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.65 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.37 
 
 		 303 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  30.74 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.06 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.28 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  33.96 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>