More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2553 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  35.43 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  41.55 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 1106 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  40.91 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 285 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 285 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 285 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  40 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  40.54 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.84 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  32.32 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  33.62 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.52 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.37 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.86 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  33.67 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.05 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2172  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.68 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.18 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.97 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  33.91 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.91 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.73 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.07 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.91 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.43 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.58 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  32.52 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.13 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  29.51 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.24 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.19 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.78 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0316  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>