209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2457 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 153 aa  304  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 153 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  58.55 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  58.5 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  58.17 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  62.59 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  61.07 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  51.66 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  56.38 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  55.63 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  57.24 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  58.39 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  57.24 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  55.1 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 152 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  59.87 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  55.92 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  55.33 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  52.63 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  52.63 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  55.92 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  53.9 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  54.49 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  50.66 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  48.99 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  52.7 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  54.9 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  53.59 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  52.63 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  53.47 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5181  endoribonuclease L-PSP  53.29 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  54.67 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  50.99 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  50.65 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  43.26 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  54.61 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  52.55 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  44.22 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  54 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  48.3 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  45.83 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  45.83 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  46.71 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  46.71 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.06 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  46.71 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  46.71 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  46.71 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>