More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1864 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  61.22 
 
 		 158 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  58.13 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  57.5 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  180  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  57.64 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 158 aa  170  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  55 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.55 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.55 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  54.61 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  45.91 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.08 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  52.08 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.77 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0959  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.31 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 155 aa  141  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  45 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3302  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1055  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2772  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.114696  normal  0.13195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2778  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000718154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1064  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356681  normal  0.744572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>