74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1727 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  45.24 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  44.05 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  41.67 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  40.96 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  41.56 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  47.14 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  43.59 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  40.48 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  41.33 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  37.04 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  43.55 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  35.37 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  37.66 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  42.67 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  43.55 
 
 		 99 aa  57  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  38.16 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  34.15 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  46.77 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  35.06 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  32.1 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  32.1 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  30.86 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  35.06 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  37.8 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  32.88 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  32.05 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  32.88 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  33.85 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  36.11 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.85 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  25.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  36.07 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  36.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  37.04 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  37.74 
 
 		 81 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  30.14 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  35.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  35.19 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  33.9 
 
 		 88 aa  40  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  29.17 
 
 		 83 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  30.56 
 
 		 79 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>