49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1558 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  99.46 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  80 
 
 		 186 aa  309  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  46.3 
 
 		 171 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  48.41 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  46.25 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  46.25 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  43.12 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  43.12 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  44.05 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  40.98 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  40.54 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  40.38 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  44.16 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  35.87 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  43.51 
 
 		 152 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 149 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  29.44 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.49 
 
 		 368 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  38.46 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  26.67 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  25.93 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  38.27 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  36.78 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  26.36 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.03 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  29.44 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.25 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  37.62 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  32.43 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  29.77 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  24 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  32.61 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.41 
 
 		 344 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  26.28 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  29.3 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  33.03 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  30.43 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  30.43 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  30.43 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  39.06 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  30.43 
 
 		 212 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>