150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0785 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 361 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  96.68 
 
 		 361 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  82.78 
 
 		 355 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  60.68 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  57.71 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  56.6 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  51.39 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  54.12 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  52.42 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  52.3 
 
 		 435 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  51.43 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  56.51 
 
 		 505 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  54.52 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  54.22 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  56.19 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  56.27 
 
 		 422 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  55.09 
 
 		 522 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  55.09 
 
 		 522 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  55.09 
 
 		 522 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  55.09 
 
 		 525 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  55.09 
 
 		 522 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  54.79 
 
 		 519 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  54.76 
 
 		 525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  48.17 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  47.63 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  49.84 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  48.8 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  47.19 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  43.83 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  41.08 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  25.86 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  30.52 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  29.5 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  26.24 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  27.54 
 
 		 248 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  25.52 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  26.21 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  29.17 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.03 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  25.74 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  30.41 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  25.87 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  28.44 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  30.35 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  30.51 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  26.73 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  25.62 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  25.74 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  30.73 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  24.26 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  26.73 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25.41 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  25.74 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  23.81 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  23.88 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  26.48 
 
 		 242 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  28.91 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  28.38 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  27.84 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  25.25 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  28.99 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  37.12 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  25.37 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  23.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  28.12 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  25.79 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  25.49 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  25.84 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  22.51 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  25.74 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  26.54 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  24.88 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  25.87 
 
 		 259 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  33.51 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  26.01 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  26.92 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  26.42 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  26.44 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  23.5 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  25.93 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  25.96 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  28.23 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  25.62 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  28.71 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  25.94 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  25.25 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  22.22 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  23.32 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  26.07 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  29.89 
 
 		 241 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  26.62 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  27.6 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>