159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0598 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0043  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.78 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.69 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  26.79 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  31.3 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.53 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.53 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 624 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  34.09 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.88 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  30.48 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.93 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  30.3 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 315 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  26.14 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  28.86 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  26.03 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  29.77 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.43 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  32.46 
 
 		 476 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  36.11 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  31.54 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.56 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  32 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.72 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.62 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 309 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 309 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.29 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 298 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  24.48 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  32.08 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 355 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.04 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.7 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  31.37 
 
 		 629 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.98 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>