More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1849 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  100 
 
 		 337 aa  694    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  81.9 
 
 		 339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  80.84 
 
 		 336 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  72.16 
 
 		 336 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  71.69 
 
 		 337 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  71.6 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  63.28 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  63.58 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  62.99 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  61.13 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  61.93 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  64.07 
 
 		 334 aa  427  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  61.68 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  61.45 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  61.03 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  63.28 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  59.4 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  62.09 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  59.52 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  59.1 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  58.81 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  57.53 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  57.36 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  57.23 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.09 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.24 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  43.44 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.69 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.46 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  42.67 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 341 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  42.28 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.08 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.91 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.8 
 
 		 331 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40.61 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.21 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.16 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40.42 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.63 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.74 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  38.98 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  40 
 
 		 344 aa  222  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.06 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  39.5 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  41.11 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  39.7 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  39.7 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  38.14 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.2 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  38.82 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  38.82 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.43 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  38.32 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.61 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>