30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0572 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 372 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  83.6 
 
 		 372 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  82.26 
 
 		 372 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1107  hypothetical protein  28.93 
 
 		 411 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0961  hypothetical protein  29.61 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1233  hypothetical protein  28.31 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0143332  normal  0.037479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1382  hypothetical protein  26.7 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1559  hypothetical protein  26.3 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158764  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01915  hypothetical protein  25.56 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  35.52 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  39.88 
 
 		 511 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  33.82 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  36.22 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 		 1300 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  35.44 
 
 		 1066 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  31.4 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  30.49 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  29.46 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.88 
 
 		 647 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  34.74 
 
 		 1831 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  33.06 
 
 		 521 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 		 550 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0540  hypothetical protein  30.23 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0525494  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3949  hypothetical protein  25.9 
 
 		 318 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  30.08 
 
 		 547 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.47 
 
 		 3027 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 702 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>