62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4134 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 318 aa  617  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  91.75 
 
 		 337 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  52.82 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 		 624 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  50.68 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  50.68 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  44.97 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  51.04 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  49.82 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  43.89 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  42.48 
 
 		 319 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  46.32 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  46.32 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  46.32 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  46.32 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  44.71 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  42.71 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  37.39 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  44.9 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  34.51 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  34.51 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  35.87 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 622 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.07 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  36.76 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  33.52 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  29.15 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  27.45 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  33.81 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  34.94 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  27.53 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  26.9 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  27.21 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.58 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  27.02 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  25.56 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  27.16 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  32.06 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  27.4 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.09 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  31.93 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.52 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  38.57 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  22.88 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  26 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  28.85 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  25.08 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>