82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3865 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  100 
 
 		 175 aa  346  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  85.06 
 
 		 174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  40.57 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  38.55 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  38.55 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  38.55 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  39.2 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.7 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  33.87 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  34.07 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.29 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.85 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.31 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  24.64 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.9 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  31.48 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  31.48 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  29.75 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  23.4 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.27 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.06 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  34 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  34 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.15 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  31.63 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  25.86 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  34 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  31.63 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  31.63 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  30.1 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  23.53 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  29.57 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.08 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  33.96 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.47 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.57 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.07 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  30.85 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  28.68 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  28.85 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.1 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  27.63 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  28.87 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.45 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  27.07 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  36.05 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  27.07 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  31.68 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  27.07 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  27.07 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  25.96 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  31.82 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.13 
 
 		 630 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.83 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  24.79 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  27.01 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  32.81 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.97 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  23.73 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  24.58 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  25.66 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  21.01 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  28.71 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  28.15 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  25.47 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  26.42 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  31.11 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  26.9 
 
 		 167 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  26.47 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  28.57 
 
 		 135 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42.31 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  26.47 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  31.06 
 
 		 185 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  26.81 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  29.57 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  27.13 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  25.66 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  31.06 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  26.47 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  27.19 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>