More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2237 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 918 aa  1863    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.91 
 
 		 913 aa  896    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.99 
 
 		 903 aa  947    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  85.05 
 
 		 923 aa  1581    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 		 828 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  33.41 
 
 		 826 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.98 
 
 		 899 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.68 
 
 		 898 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.6 
 
 		 893 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  31.89 
 
 		 828 aa  426  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 815 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.09 
 
 		 893 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 		 821 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.97 
 
 		 893 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.66 
 
 		 900 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.86 
 
 		 917 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 		 821 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 920 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.54 
 
 		 823 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  35.53 
 
 		 879 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 797 aa  376  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  32.61 
 
 		 844 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 		 886 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  38.44 
 
 		 835 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.14 
 
 		 900 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 		 822 aa  365  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.34 
 
 		 904 aa  365  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 		 822 aa  364  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.08 
 
 		 903 aa  363  6e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  34.93 
 
 		 784 aa  362  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  33.84 
 
 		 831 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.75 
 
 		 983 aa  363  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 984 aa  362  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 984 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.57 
 
 		 959 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 984 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 984 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 		 984 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 960 aa  360  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.43 
 
 		 984 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.43 
 
 		 984 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.83 
 
 		 911 aa  359  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.79 
 
 		 984 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 948 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.32 
 
 		 960 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  35.36 
 
 		 782 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.36 
 
 		 782 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 		 944 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  32 
 
 		 960 aa  357  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.08 
 
 		 959 aa  357  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.22 
 
 		 960 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.3 
 
 		 959 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  35.37 
 
 		 717 aa  356  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  29.72 
 
 		 982 aa  356  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.57 
 
 		 959 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  34.02 
 
 		 715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 960 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.99 
 
 		 960 aa  354  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.63 
 
 		 952 aa  354  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.12 
 
 		 983 aa  354  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.9 
 
 		 983 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  37.48 
 
 		 863 aa  353  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  34.46 
 
 		 809 aa  352  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 959 aa  352  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.72 
 
 		 788 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.19 
 
 		 982 aa  352  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.01 
 
 		 983 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.7 
 
 		 959 aa  351  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.26 
 
 		 946 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.83 
 
 		 948 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.51 
 
 		 1000 aa  350  8e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  34.75 
 
 		 777 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 979 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.3 
 
 		 983 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.74 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.41 
 
 		 983 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  36.3 
 
 		 777 aa  349  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.41 
 
 		 983 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.77 
 
 		 905 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  35.84 
 
 		 779 aa  347  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  35.11 
 
 		 714 aa  348  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  35.31 
 
 		 839 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.85 
 
 		 947 aa  347  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  34.7 
 
 		 777 aa  346  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.61 
 
 		 969 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  35.72 
 
 		 829 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 		 850 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  34.49 
 
 		 710 aa  344  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.89 
 
 		 948 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.16 
 
 		 798 aa  343  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.95 
 
 		 967 aa  343  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.82 
 
 		 966 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 		 901 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.5 
 
 		 994 aa  343  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  36.14 
 
 		 776 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 808 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.97 
 
 		 956 aa  342  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 		 946 aa  341  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  36.14 
 
 		 776 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.76 
 
 		 947 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>