101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0668 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  86.6 
 
 
97 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  89.8 
 
 
98 aa  141  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  51.04 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  43.75 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  47.31 
 
 
95 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  41.24 
 
 
97 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  39.58 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  48.96 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  46.88 
 
 
106 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  41.05 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  37 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  39.58 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  36.17 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  30.61 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  30.61 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  36.73 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  36.73 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  44.93 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  42.35 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  27.84 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  40.4 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  32.05 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  35.44 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  32.05 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  38.3 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  52.46 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  46.34 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  43.21 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  43.04 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  37.66 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  38.27 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  35.35 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  30.21 
 
 
100 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  50.88 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  34.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  35.37 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  39.58 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  42.55 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  36 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  30.21 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  40.98 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  41.77 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  43.94 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  35.8 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  38.03 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  34.29 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  44.32 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  35.8 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  36.84 
 
 
99 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  40.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  40.74 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  27.62 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  33.77 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  40.68 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  43.21 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  29.9 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  32.32 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  29.76 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  40.62 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  41.18 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  35.42 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  36.51 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  32 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  39.06 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2594  hypothetical protein  38.57 
 
 
81 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  40.66 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  41.98 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>