More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5107 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5107  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014973  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  83.72 
 
 
258 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1660  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 
254 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0508475  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0802  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
262 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3576  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
256 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  51.2 
 
 
267 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2115  enoyl-CoA hydratase  52.96 
 
 
281 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4618  enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 
264 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.246511  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3304  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 
256 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
260 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
261 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
260 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
262 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
260 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
268 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.79 
 
 
260 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
260 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.79 
 
 
260 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
260 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
257 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
259 aa  135  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.61 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
260 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.73 
 
 
659 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.37 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.12 
 
 
259 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
260 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
265 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.89 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
258 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.15 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.8 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
258 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.92 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.94 
 
 
663 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
267 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
257 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 
260 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
262 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
260 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
257 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
260 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
254 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
257 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
259 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 
266 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
256 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
258 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
257 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  34.44 
 
 
269 aa  122  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
260 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
258 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
257 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
269 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
262 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
257 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
259 aa  121  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>