75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3025 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  219  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  88.57 
 
 		 105 aa  193  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  96.77 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  95.7 
 
 		 93 aa  183  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  92.47 
 
 		 93 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  92.47 
 
 		 93 aa  179  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  91.4 
 
 		 93 aa  177  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  81.32 
 
 		 94 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  79.25 
 
 		 106 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  80.22 
 
 		 91 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  70.41 
 
 		 98 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  84.72 
 
 		 94 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  74.19 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  84.51 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  84.29 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  84.29 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  83.1 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  62.67 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  54.41 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  58.46 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  58.46 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  54.67 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  61.67 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  51.95 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  56.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  50.68 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  55.38 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  55.38 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  50.67 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  51.43 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  49.37 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  50.72 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  53.73 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  53.23 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  52.31 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  53.23 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  56.45 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  53.85 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  50.72 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  51.61 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  53.12 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  52.54 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  52.54 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  51.67 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  51.56 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  43.24 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  49.15 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  49.18 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  44.26 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  49.12 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  44.26 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  48.28 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  40.85 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  47.14 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  52 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  42.19 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  47.17 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  33.77 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  32.43 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  37.14 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  50 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  35.59 
 
 		 69 aa  40  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  41.38 
 
 		 73 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>